Los ataques de protocolo aprovechan una característica específica o un error de implementación de algún protocolo instalado en la víctima para consumir cantidades excesivas de sus recursos. Este tipo de ataque consume recursos reales del servidor, o de equipos de comunicación intermedios, como cortafuegos y equilibradores de carga, y se mide en paquetes por segundo (pps). Los ataques de protocolo comunes incluyen el ataque smurf, el ataque SYN, el ataque UDP, el ataque ICMP, el ataque de solicitud CGI, el ataque al servidor de autenticación, el ataque utilizando sistemas DNS y el ataque utilizando direcciones falsificadas en ping.